El 25 de marzo de 1899 se creó, en la Biblioteca de la Universitat de València, el Colegio de Doctores y Licenciados en Ciencias y en Filosofía y Letras. La Primera Junta se mantuvo hasta 1936, fecha en que se trasladó el Colegio a la C/ Palau 14 y, posteriormente, al Instituto Luis Vives. Fue disuelto el 27 de mayo de 1937, aunque se mantuvo un Colegio o delegación de Alicante.
Tras la guerra, se volvió a constituir, con un nuevo censo de colegiados, el 28 de septiembre de 1939, ahora como Colegio de Doctores y Licenciados en Filosofía y Letras y en Ciencias. Será su sede la Biblioteca de la Facultad de la Filosofía y Letras de la c/ La Nave.
En 1942 se crea la delegación de Alicante.
En 1943 se trasladó a la Biblioteca General.
En 1971 la sede se trasladó a la Pl. Alfonso el Magnánimo, 3 y en 1975 a su actual ubicación.
En la actualidad, tanto la Junta de Gobierno, como las comisiones de Arqueología, Ciencias y Pedagogía, así como el personal administrativo, siempre abiertos a todo tipo de iniciativas, intentan dar respuesta a las necesidades profesionales de los colegiados.